Los orígenes de la actual población se remontan, al menos, a la Edad del Bronce (en torno al 1.500 a. C.), período de la prehistoria al que pertenece un pequeño poblado localizado en la “Peña Ajuerá” enclave cercano a la población, en el que se encontraron fragmentos de cerámicas hechas a mano correspondientes a la Edad de Bronce, percutor de caliza y molino de mano.

            Ya de la época Romana existen importantes restos de una Villa en la partida de los terreros de Zorrilla de donde procede una interesante inscripción funeraria actualmente colocada en la fachada de la Iglesia.

            Lo que si parece incuestionable es que el topónimo Azuébar es de orígen árabe, y con toda probabilidad también se debe considerar que fueron los musulmanes los que establecieron la actual ubicación de la villa al menos tal y como se entiende en la actualidad.

           Tras la "Guerra de la Sierra de Espadán" y en medio de una ofensiva clerical intentando convertir a un cristianismo practicante a la población morisca, el rey Felipe II se plantea la fortificación de algunos enclaves de la geografía valenciana. Uno de estos enclaves fue la Sierra de Espadán, que finalmente no fue fortificada. Tanto la nobleza como el clero hicieron causa común y progresivamente fueron conculcándose los pocos derechos que restaban a los moriscos y finalmente en el año 1609 se producirá su definitiva expulsión, quedando la población totalmente deshabitada.

           La expulsión de la población morisca, supuso en Azuébar un punto y aparte en su historia, sus costumbres y en general en todos los aspectos tanto socio-políticos como económicos, debido al cambio de pobladores y de las nuevas condiciones de población.

            La Carta de Población de 1609 concedida por el señor de Azuébar José Folch de Cardona facilitó la llegada de nuevos pobladores que iniciarán una nueva etapa ya exclusivamente cristiana que será el origen de la actual población. Documento por el cual se dotaba de población al municipio, que habían quedado totalmente despoblados tras la entonces reciente expulsión de los moriscos que los habitaban.